• 1979: Giải Arthur S. Flemming[27]
• 1995: Giải Ernst Jung (chia sẻ cùng với Samuel A. Wells, Jr.)[28]
• 1996: Tiến sĩ khoa học danh dự, Đại học Colgate, cho những quan sát tiên phong về phản ứng miễn dịch của con người và theo đuổi vắc-xin AIDS[29]
• 1999: Bằng Tiến sĩ danh dự về Dịch vụ Công, Đại học Shippensburg, Pennsylvania
• 2002: Giải Trung tâm Y tế Albany[30]
• 2003: Giải Đĩa Vàng của Học viện Thành tựu Hoa Kỳ [31]
• 2005: Huân chương Khoa học Quốc gia[32]
• 2005: Giải Thành tựu trọn đời của Hiệp hội Miễn dịch học Hoa Kỳ[33]
• 2007: Mary Woodard Lasker Public Service Award[34]
• 2008: Huân chương Tự do của Tổng thống[31]
• 2013: Huân chương Vàng Robert Koch[35]
• 2013: Giải Prince Mahidol[36]
• 2016: Giải Y tế Toàn cầu John Dirks Canada Gairdner[37]

Fauci là giáo sư thỉnh giảng tại nhiều trung tâm y tế và nhận được 30 bằng tiến sĩ danh dự từ các trường đại học ở Hoa Kỳ và nước ngoài.[25]